BIODIVERSITÉ AU PREMIER REGARD

Dernière mise à jour le 25/ 06/ 2000

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Résumé: Il est généré ici une carte bidimensionnelle de données à partir de quelques séquences de bases fournies de l’ADN.

Brève introduction: La transcription des séquences de bases de l’ADN aux respectives séquences complémentaires dans le m-ARN est un système de sécurité et de haute précision de communication qui traverse la membrane nucléaire. La biodiversité de l’information génétique originale est emmagasinée dans l’ADN dans le noyau de la cellule et elle y reste. L’information génétique dans le m-ARN est reconnue par le t-ARN lequel assemble un aminoacide propre en accord avec le respectif codon du m-ARN. Le r-ARN est l’intermédiaire suivant dans la construction de la protéine, il y a transcription, traduction, ligature des composants de la protéine spécifique qui est synthétisée. Les trois types de molécules de l’ARN permettent la formation de la chaîne polypeptidique pour constituer la protéine. Cette opération est exécutée parfaitement et presque sans exceptions. Une copie imparfaite de l’ADN résultera en mutations, une nouvelle biodiversité sera formée.

Carte de bases: la reconnaissance visuelle d’une séquence de milliers de bases dans une molécule du ADN à première vue est difficile pour n’importe quel observateur. La séquence de bases examinée par l’ordinateur est sûrement plus fiable. Cette reconnaissance peut être plus rapide avec la carte de bases bidimensionnelle qui nous proposons ici. L’objectif n’est pas remplacer le système actuel de codes de l’ADN, mais montrer une figure condensée dans laquelle chaque base est représentée par un point.

Test de sensibilité: n’importe quelle séquence jusqu’à 1000 bases peut être utilisée comme entrée dans ce test. Il faut pointer et cliquer la souris sur le bouton dans la base souhaitée de l’application ci-dessous. La représentation dans la carte de bases est faite avec un point en haut ou en bas, à gauche ou à droite de l’origine ou de la dernière localisation si la base est T ou A ou G ou C respectivement. À n’importe quel moment, après localiser n bases, l’on peut observer le respectif n bases en cliquant le bouton INPUT MAP. En cliquant le bouton RADNDOM MAP l’on peut observer une carte base aléatoirement. Comme dans l’exemple sélectionné, la séquence des bases de l’ADN du virus Hendra Hendra (M. Yu, E. Hansson, J. P. M. Langedijk, B.T. Eaton e L.F. Wang; Virology, 251, 227-233, 1998), peut être observée après cliquer sur le bouton He V 0-1000 SEQUENCE ou dans la respective carte-de-bases sur le bouton He V 0- 1000 MAP. Pour tester une nouvelle séquence de bases de l’ADN, les anciennes données peuvent être effacées cliquant sur CLEAN INPUT.

Ce travail est une version améliorée et augmentée d’un prototype présenté dans le " DNA Fingerprinting Second International Congress ", à Belo Horizonte, MG, le 9/11/1992.

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